Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2BQ00403 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2BQ00403 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms