Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMF1P82094 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMF1P82094 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMF1P82094 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMF1P82094 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TMF1P82094 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMF1P82094 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMF1P82094 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMF1P82094 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMF1P82094 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMF1P82094 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMF1P82094 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms