Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
IRX6P78412 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
IRX6P78412 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
IRX6P78412 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX6P78412 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX6P78412 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX6P78412 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX6P78412 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX6P78412 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX6P78412 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IRX6P78412 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IRX6P78412 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms