Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN10P78369 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN10P78369 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN10P78369 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN10P78369 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN10P78369 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms