Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PITX1P78337 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITX1P78337 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX1P78337 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX1P78337 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX1P78337 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX1P78337 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX1P78337 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms