Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HBBP68871 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HBBP68871 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBBP68871 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBBP68871 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBBP68871 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HBBP68871 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HBBP68871 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HBBP68871 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms