Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO1P63165 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO1P63165 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms