Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL11P62913 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL11P62913 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL11P62913 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL11P62913 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL11P62913 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL11P62913 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL11P62913 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL11P62913 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL11P62913 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL11P62913 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL11P62913 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL11P62913 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms