Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPEP62304 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms