Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
RPS29P62273 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RPS29P62273 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RPS29P62273 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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