Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC1P62191 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms