Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP46P62068 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP46P62068 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP46P62068 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP46P62068 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP46P62068 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP46P62068 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP46P62068 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP46P62068 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP46P62068 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP46P62068 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms