Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVK-21P61565 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-21P61565 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms