Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP25P60880 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP25P60880 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms