Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms