Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AIF1P55008 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms