Protein–RNA interactions for Protein: P54687

BCAT1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAT1P54687 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCAT1P54687 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAT1P54687 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms