Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATN1P54259 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATN1P54259 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATN1P54259 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATN1P54259 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms