Protein–RNA interactions for Protein: P54098

POLG, DNA polymerase subunit gamma-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLGP54098 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLGP54098 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLGP54098 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLGP54098 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLGP54098 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLGP54098 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLGP54098 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLGP54098 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLGP54098 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLGP54098 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms