Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THOP1P52888 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
THOP1P52888 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOP1P52888 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOP1P52888 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOP1P52888 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOP1P52888 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOP1P52888 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THOP1P52888 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THOP1P52888 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOP1P52888 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms