Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV2P52735 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV2P52735 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV2P52735 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV2P52735 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAV2P52735 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAV2P52735 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAV2P52735 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAV2P52735 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV2P52735 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV2P52735 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV2P52735 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV2P52735 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV2P52735 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV2P52735 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV2P52735 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV2P52735 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV2P52735 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV2P52735 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV2P52735 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms