Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP11P51784 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP11P51784 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP11P51784 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP11P51784 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP11P51784 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP11P51784 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP11P51784 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP11P51784 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP11P51784 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP11P51784 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms