Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBP50607 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBP50607 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBP50607 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBP50607 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBP50607 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBP50607 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBP50607 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBP50607 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBP50607 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBP50607 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms