Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP1P50238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms