Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFBP49765 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFBP49765 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms