Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK2P49760 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK2P49760 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK2P49760 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK2P49760 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK2P49760 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK2P49760 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK2P49760 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK2P49760 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLK2P49760 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK2P49760 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK2P49760 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK2P49760 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms