Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX1P48742 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX1P48742 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX1P48742 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX1P48742 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX1P48742 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX1P48742 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX1P48742 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms