Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMTP48728 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMTP48728 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMTP48728 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMTP48728 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms