Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NESP48681 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NESP48681 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NESP48681 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NESP48681 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NESP48681 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NESP48681 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
NESP48681 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NESP48681 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NESP48681 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NESP48681 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NESP48681 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NESP48681 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NESP48681 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NESP48681 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
NESP48681 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NESP48681 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NESP48681 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NESP48681 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NESP48681 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NESP48681 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NESP48681 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NESP48681 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
NESP48681 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NESP48681 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NESP48681 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NESP48681 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NESP48681 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NESP48681 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms