Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT6CP48668 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT6CP48668 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT6CP48668 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT6CP48668 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms