Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF4P48230 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms