Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSN1S1P47710 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms