Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRCC3P46736 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCC3P46736 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms