Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP2P46087 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP2P46087 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP2P46087 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP2P46087 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP2P46087 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP2P46087 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP2P46087 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP2P46087 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP2P46087 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP2P46087 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP2P46087 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP2P46087 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOP2P46087 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms