Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCG1P45844 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG1P45844 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms