Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP13P45452 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP13P45452 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP13P45452 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP13P45452 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP13P45452 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms