Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCCP43146 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCCP43146 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCCP43146 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DCCP43146 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DCCP43146 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DCCP43146 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DCCP43146 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DCCP43146 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DCCP43146 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DCCP43146 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DCCP43146 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DCCP43146 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DCCP43146 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DCCP43146 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DCCP43146 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DCCP43146 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DCCP43146 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms