Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDF5P43026 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDF5P43026 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDF5P43026 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GDF5P43026 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDF5P43026 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms