Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5CP41229 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5CP41229 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms