Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 GRX1YCL035C 333 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RRM3YHR031C 2172 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 MYO5YMR109W 3660 nt3.09□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 UBP8YMR223W 1416 nt3.09□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 VAC8YEL013W 1737 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR442WYDR442W 393 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YGR018CYGR018C 330 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 MRPL6YHR147C 645 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 DID4YKL002W 699 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SMA2YML066C 1110 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YMR087WYMR087W 855 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 PFK27YOL136C 1194 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 GPI2YPL076W 843 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 ESL1YIL151C 3357 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 CLN2YPL256C 1638 nt3.08□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SRC1YML034W 2505 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 RMD5YDR255C 1266 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR355CYDR355C 303 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 DDI2YFL061W 678 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 POP6YGR030C 477 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 PEF1YGR058W 1008 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 RPS22AYJL190C 393 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SPO20YMR017W 1194 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YMR310CYMR310C 954 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 BUD21YOR078W 645 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SUR1YPL057C 1149 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YPR053CYPR053C 456 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 MSH2YOL090W 2895 nt3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 XRN1YGL173C 4587 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 RIM1YCR028C-A 408 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 GYP7YDL234C 2241 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 HMF1YER057C 390 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YKL091CYKL091C 933 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YLR311CYLR311C 348 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 TEX1YNL253W 1269 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 PPT2YPL148C 522 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 TIF4631YGR162W 2859 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YER138CYER138C 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YER160CYER160C 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YJR027WYJR027W 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YML039WYML039W 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YML045WYML045W 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YMR050CYMR050C 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 TOM1YDR457W 9807 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 CHS3YBR023C 3498 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 PBI1YPL272C 1554 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDL026WYDL026W 312 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 MIX14YDR031W 366 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 CGR1YGL029W 363 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 CFD1YIL003W 882 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SSN8YNL025C 972 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 HHF2YNL030W 312 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 ATG3YNR007C 933 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 RPL33AYPL143W 324 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 CIN1YOR349W 3045 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 CDC20YGL116W 1833 nt3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 PLM2YDR501W 1566 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YPL216WYPL216W 3309 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SMT3YDR510W 306 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YAR075WYAR075W 474 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 HNT3YOR258W 654 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 MUM2YBR057C 1101 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDL199CYDL199C 2064 nt3.04□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 SLH1YGR271W 5904 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 TSC11YER093C 4293 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 BPT1YLL015W 4680 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 NHP10YDL002C 612 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 RDI1YDL135C 609 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YDR250CYDR250C 276 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 RSM26YJR101W 801 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 TDA8YAL064C-A 381 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 COS1YNL336W 1146 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YBL096CYBL096C 309 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 YOR331CYOR331C 558 nt3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P40486 VPS3YDR495C 3036 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 DYN2YDR424C 279 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YDR491CYDR491C 492 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 GRX2YDR513W 432 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YGL218WYGL218W 651 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 GPI14YJR013W 1212 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YKR011CYKR011C 1062 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 YBR300CYBR300C 498 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 DBP7YKR024C 2229 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 VAS1YGR094W 3315 nt3.02□□□□□ -1.93
SHQ1P40486 CCT7YJL111W 1653 nt3.01□□□□□ -1.93
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