Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THPOP40225 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THPOP40225 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THPOP40225 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THPOP40225 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THPOP40225 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THPOP40225 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THPOP40225 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms