Protein–RNA interactions for Protein: P40048

PTP3, Tyrosine-protein phosphatase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP3P40048 FUS1YCL027W 1539 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP3P40048 ECM3YOR092W 1842 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP3P40048 MED11YMR112C 396 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP3P40048 TRP5YGL026C 2124 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP3P40048 TRE1YPL176C 2352 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP3P40048 RVB1YDR190C 1392 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP3P40048 APE3YBR286W 1614 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YVC1YOR087W 2028 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YCR050CYCR050C 309 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YDL034WYDL034W 345 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 SEC53YFL045C 765 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 ECO1YFR027W 846 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 COA1YIL157C 594 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 EMC2YJR088C 879 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 PAI3YMR174C 207 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YBP2YGL060W 1926 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 YOR365CYOR365C 2112 nt7.54□□□□□ -1.2
PTP3P40048 LEU1YGL009C 2340 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP3P40048 SNZ3YFL059W 897 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP3P40048 ICY1YMR195W 384 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP3P40048 FSH3YOR280C 801 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP3P40048 SMF2YHR050W 1650 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP3P40048 ACS2YLR153C 2052 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP3P40048 ATP5YDR298C 639 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MRPL38YKL170W 417 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 FUS2YMR232W 2034 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 YNR063WYNR063W 1824 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 TDA11YHR159W 1515 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MCM3YEL032W 2916 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SPB4YFL002C 1821 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 AEP3YPL005W 1821 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 APQ12YIL040W 417 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SHE2YKL130C 741 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 YNL338WYNL338W 159 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 UBX5YDR330W 1503 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 YPS7YDR349C 1791 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 TUB3YML124C 1338 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 HIS7YBR248C 1659 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 PYC2YBR218C 3543 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SDH7YDR511W 402 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP3P40048 REE1YJL217W 597 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP3P40048 UTP11YKL099C 753 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP3P40048 snR36snR36 182 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SFB3YHR098C 2790 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP3P40048 RAD3YER171W 2337 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP3P40048 DPB4YDR121W 591 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 BSC2YDR275W 708 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 TDH3YGR192C 999 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 RPS24BYIL069C 408 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MRS1YIR021W 1092 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MIM2YLR099W-A 264 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 TDA5YLR426W 981 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 RPS10AYOR293W 318 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 DHR2YKL078W 2208 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 YJR003CYJR003C 1560 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 GAS3YMR215W 1575 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP3P40048 PEP7YDR323C 1548 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 CTS1YLR286C 1689 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 YDR109CYDR109C 2148 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 ARO2YGL148W 1131 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 RPL8AYHL033C 771 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 VPS63YLR261C 327 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 YOL114CYOL114C 609 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 POF1YCL047C 777 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 TOG1YER184C 2385 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 RTS1YOR014W 2274 nt7.48□□□□□ -1.21
PTP3P40048 SUP35YDR172W 2058 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 APP1YNL094W 1764 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 RPC11YDR045C 333 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 POL12YBL035C 2118 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 snR48snR48 113 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 KKQ8YKL168C 2175 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MTL1YGR023W 1656 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 HRD1YOL013C 1656 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP3P40048 VPS9YML097C 1356 nt7.46□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MMP1YLL061W 1752 nt7.46□□□□□ -1.21
PTP3P40048 MTM1YGR257C 1101 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 NBL1YHR199C-A 222 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 PAM16YJL104W 450 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 YBR016WYBR016W 387 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 TIM18YOR297C 579 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 YPL114WYPL114W 420 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 ATG20YDL113C 1923 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 DBF2YGR092W 1719 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 TSL1YML100W 3297 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 PUB1YNL016W 1362 nt7.46□□□□□ -1.22
PTP3P40048 GSH1YJL101C 2037 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 COX26YDR119W-A 201 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 RPB9YGL070C 369 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 VMA10YHR039C-A 345 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 RGI2YIL057C 495 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 RPL9BYNL067W 576 nt7.45□□□□□ -1.22
PTP3P40048 YCL022CYCL022C 516 nt7.45□□□□□ -1.22
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