Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms