Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP6V1E1P36543 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms