Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA3P35244 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA3P35244 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA3P35244 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA3P35244 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms