Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNB1P35222 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNB1P35222 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms