Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C19P33261 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C19P33261 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms