Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms