Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM4SF1P30408 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms