Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPP30301 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPP30301 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPP30301 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIPP30301 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIPP30301 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPP30301 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPP30301 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPP30301 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPP30301 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPP30301 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPP30301 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPP30301 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPP30301 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms